U. C.0097时期，“拉普拉斯事项”的纷争终结后，2架独角兽高达被奥秘封印，新吉翁残党“袖章”也随之崩溃。就在人类逐步走出战争带来的暗影之时，掉落两年的独角兽三号机“凤凰”忽然现身，拥有倾覆世界次序实力的它立时激起了地球联邦军、吉翁袖章残党以及路欧商会三方势力的争夺佃猎，一场宇宙对决也行将拉开帷幕......