《黑子的篮球》故事重要围绕两位主人公——被誉为第六位“事业世代”的黑子哲也以及从美国回来的天才篮球选手火神大我展开，两人在球场上市光与影的同伴。相遇后的他们将应战其他五位“事业世代”。

时值2710年，奈良迎来了迁都2000周年纪念。为了保护文化遗产和历史遗迹，保存着文化财产的超巨大大厦矗立在奈良古城。故事的主人公高中二年级的新市来到奈良修学旅行。到达之后，就发现触目所及都是鹿，鹿，鹿……新市觉得厌烦，就在这时，一只白鹿抢走了新市的包。新市追着白鹿在奈良街头狂奔。混乱中，被追捕的神秘美少女脱脱无意帮助了新市，…